• Uiterste inschrijvingsdatum: 31-08-2010 17:00
• Vakgroep/directie/dienst: LA14 - Vakgroep Moleculaire Biotechnologie
• Type contract: bepaald
• Diploma: Recent diploma van Bio-ingenieur, Lic Biomedische Wetenschappen, Lic Biotechnologie, Lic Farmaceutische Wetenschappen.
• Bezetting: 100%
• Vacature type: wp

Functieinhoud

In het kader van een boeiend onderzoeksproject gefinancierd door de universiteit Gent is een doctoraatspositie beschikbaar.
De titel van het project is: Onderzoek naar de moleculaire pathogenese van Chlamydophila psittaci in humane macrofagen en epitheelcellen: genomics, proteomics en methylomics van hoog en laag virulente stammen.

Het betreft een doctoraatsbeurs voor 2 jaar (met mogelijkheid tot verlenging)

Het onderzoekswerk zal uitgevoerd worden aan het Laboratorium voor Immunologie de Biotechnologie van de dierlijke cel (Vakgroep Moleculaire Biotechnologie, Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen, Universiteit Gent) en het Laboratorium voor Farmaceutische Biotechnologie (Vakgroep Geneesmiddelenleer, Faculteit Farmaceutische Wetenschappen, Universiteit Gent) onder leiding van Prof. Dr. D. Vanrompay, Prof. Dr. D. Deforce en Prof. Dr. W. Van Criekinge. Het onderzoek loopt in samenwerking met het Next Generation Sequencing’ Consortium NXT-GNT.

Onderzoek
. Genoomanalyse en proteomics van hoog virulente genotype A en D stammen en een laag virulente genotype B stam moet toelaten om de aanwezigheid van type III secretie-gerelateerde virulentiegenen en effectoreiwitten te onderzoeken. Voorts willen we nagaan of er een histon methylase (SET-domein eiwit) voorkomt bij de verschillende genotypen, aangezien dit methylase een rol zou kunnen spelen bij de morfologische omschakeling van niet-infectieuze naar infectieuze bacteriën tijdens de intracellulaire bacteriële vermeerderingscyclus.]1[Chlamydophila psittaci is een obligaat intracellulaire Gr- bacterie die vermeerdert in epitheelcellen en monocyten/macrofagen van vogels en van de mens. Er is weinig gekend over de virulentiemechanismen van deze bacterie, doch genotype A en D stammen lijken meer pathogeen voor de mens dan genotype B stammen. Het bacteriële type III secretiesysteem (T3SS) speelt vermoedelijk een rol in de moleculaire pathogenese en de waargenomen virulentieverschillen  

Technieken o.a.:
Genoomanalyse (pyrosequencing), proteomics, yeast two-hybrid system, recombinante eiwitproductie, real-time PCR, isolatie van primaire humane cellen en werken met continue humane cellijnen, isolatie van chlamydia in celculturen, aanmaak polyklonale en monoklonale antistoffen, 2-D gelelektroforese, immunoblotting, confocale laser scanning microscopie,…..

Functieprofiel

Sterke motivatie om wetenschappelijk onderzoek te verrichten en een doctoraat te behalen.
Sterke interesse in moleculaire biologie en bio-informatica.

Hoe solliciteren

Geïnteresseerde kandidaten worden verzocht hun kandidatuur te sturen naar:

Prof. Dr. D. Vanrompay
Vakgroep Moleculaire Biotechnologie
Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen, UGent
Coupure links, 653
9000 Gent
Tel: (0)9 2645972; Fax: +32(0)9 2646219
E-mail: Daisy.Vanrompay@ugent.be