Doctoraatsbursaal

Uiterste inschrijvingsdatum
Mar 01, 2018 13:35
Vakgroep/directie/dienst
FW01 - Vakgroep Geneesmiddelenleer
Type contract
Contract van bepaalde duur
Diploma
• Master of equivalent in Moleculaire celbiologie, Geneeskunde, Farmacie, Bio-informatica, Biotechnologie, Bio-ingenieurswetenschappen, Biochemie, Genetica of equivalent.
Bezetting
100%
Vacature type
Overig academisch personeel

Functieomschrijving

Het volgende hoofdstuk in Epigenetica: Het ontcijferen van de “histon code” aan de hand van massaspectrometrie

Beschrijving:

Het Labo voor Farmaceutische Biotechnologie, Universiteit Gent, zoekt een gemotiveerde doctoraatstudent die geïnteresseerd is in epigenetica en het gebruik van massaspectrometrie op proteïnen. De student zal binnen een team van vier doctoraatsstudenten en één postdoc werken aan de ontwikkeling van nieuwe massaspectrometrische methoden voor de analyse en interpretatie van posttranslationele modificaties op histonen. Deze methoden kunnen worden gebruikt voor onderzoek op alle Eukaryote organismen en zijn voorbestemd om nieuwe fundamentele inzichten te genereren in de epigenetica. Momenteel lopen fundamentele projecten rond stamceldifferentiatie, epigenetische veranderingen in driedimensionale celculturen en immunologische epigenetische overerving in Arthropoda. Een meer toegepaste onderzoekslijn is de ontwikkeling van een nieuwe epigenetische toxicologische assay. De kandidaat zal de data-analyse en bioinformatica verder helpen ontwikkelen onder begeleiding van een derdejaars doctoraatsstudent die hierin is gespecialiseerd, alsook deze pijplijnen gebruiken om verschillende biologische vragen te beantwoorden binnen (interuniversitaire) samenwerkingen die via ProGenTomics (www.progentomics.be) tot stand komen.

Taakbeschrijving:

  • • Vertrekkende van de data die wordt gegenereerd op de MS-toestellen in het labo (SynaptG2Si en TripleTOF) nieuwe perspectieven verkennen om additionele informatie te extraheren uit de data. Deze nieuwe benaderingen komen dynamische tot stand in brainstormsessies en obv de noden die ontstaan bij de collega’s.
  • • De bestaande (commerciële) data-analyse pijplijnen gebruiken om biologische inzichten te extraheren uit data gegenereerd in samenwerkingsverbanden (ProGenTomics).
  • • Faciliteren en parsen van de data-analyse van je collega’s, die zijn gespecialiseerd in het wet lab, de sample prep en de bediening van de instrumenten.
  • • Mogelijks begeleiden van Master thesis projecten en geven van practica aan de Faculteit Farmaceutische Wetenschappen.

Functieprofiel

Profiel van de kandidaat:

Een sterke achtergrond en relevante expertise in bio-informatica, biotechnologie en/of massaspectrometrie zijn een afgetekend voordeel. Interesse en gedrevenheid in data mining en bio-informatica zijn noodzakelijk.

  • • Master of equivalent in Moleculaire celbiologie, Geneeskunde, Farmacie, Bio-informatica, Biotechnologie, Bio-ingenieurswetenschappen, Biochemie, Genetica of equivalent.
  • • De kandidaat is open van geest en heeft interesse in fundamenteel onderzoek, is communicatief, analytisch en denkt dynamisch en lost problemen zelfstandig op. • Goede communicatie- en schrijfvaardigheid in het Engels stemt tot aanbeveling.
  • • Kennis van een programmeertaal zoals Python is een voordeel
  • • Kennis van massaspectrometrie is een voordeel •
  • Affiniteit met en kennis van statistiek is een voordeel

Aanvang:

In onderling overleg. Kan vanaf heden.

Applicaties moeten doorgestuurd worden voor 1 maart 2018.

Solliciteren

CV doorsturen naar:

Dr. Maarten Dhaenens,

Labo Farmaceutische Biotechnologie

Ottergemsesteenweg 460, 9000 Gent, België

Email: