Onderzoeksgroep Bart Devreese

Onderzoeksonderwerpen

Antimicrobiële resistentie en virulentie van opportunistische pathogenen

We gebruiken proteomics om bacteriële mechanismen van resistentie en persistentie tegen antimicrobiële behandeling te onderzoeken. Onze interesse gaat vooral uit naar de betrokkenheid van membraanblaasjes bij antibioticumresistenties en hun verspreiding. Ook zijn we betrokken bij onderzoek naar de structurele biologie van toxine/antitoxine complexen die instaan voor persistentie.

Door secretoom analyse bepalen we ook de waaier aan virulentiefactoren die pathogenen vrijstellen om gastheercellen te infecteren. Onze focus ligt op extracellulaire enzyme zoals proteasen en fosfolipasen die immunologische responseiwitten van de gastheercel afbreken. Soorten die we onderzoeken zijn pathogenen betrokken bij luchtweginfecties van patiënten met cystic fibrosis, en de plantpathogeen Streptomyces scabies.

Enzymen voor Groene Chemie

Enzymen zijn een excellent alternatief voor klassieke catalyse in chemische reacties. De ecologische voetafdruk van een enzymatische reactive is meestal veel lager door een verminderd verbruik van zuur of base, lagere reactietemperatuur en minder bijproducten. We ondersteunen industriële partners bij het selecteren en engineeren van enzymen voor initiële proof-of-concept studies naar haalbaarheidsstudies om enzymen in hun bestaande reactieschema's in te brengen. Hierbij focussen we op hydrolytische en redox actieve enzymen.

Proteomics platform en kwantitatieve metabolietanalyse

Onze onderzoeksgroep heeft uitgebreide ervaring op het vlak van eiwitanalyse, inclusief kwantitieve proteomics en de studie van post-translationele modificaties. Wij hebben ook uitgebreide ervaring met eiwit expressie en engineering in E. coli en P. pastoris.  Verder gebruiken we massaspectrometrie voor de identificatie en kwantificering van secundaire metabolieten van bacteriën en fungi. Wij staan open voor samenwerking met zowel academische groepen als bedrijven. Voor meer informatie contacteer Bart Devreese.

Belangrijke publicaties

1. Diao, Z., Roelants, SLKW, Luyten, G.,Goeman, J.,  Vandenberghe, I., Van Driessche, G., De Maeseneire, S.L., Soetaert, W.K., Devreese, B.
Revision of the sophorolipid biosynthetic pathway in Starmerella bombicola based on new insights in the substrate profile of its lactone esterase
Biotechnol. Biofuels and Bioprod. (2024), 17, 89.

2. Devos S, Van Putte W, Vitse J, Van Driessche G, Stremersch S, Van Den Broek W, Raemdonck K, Braeckmans K, Stahlberg H, Kudryashev M, Savvides SN, Devreese B. Membrane vesicle secretion and prophage induction in multidrug-resistant Stenotrophomonas maltophilia in response to ciprofloxacin stress. Environ Microbiol. (2017) 19, 3930-3937.

3. Depluverez, S., Devos, S., Devreese, B. The Role of Bacterial Secretion Systems in the Virulence of Gram-Negative Airway Pathogens Associated with Cystic Fibrosis. Frontiers Microbiol. (2016) 7, 1336.

4. Wen Y, Behiels E, Devreese B. Toxin-Antitoxin systems: their role in persistence, biofilm formation and pathogenicity. Pathog Dis (2014) 70, 240-249.

5. Wen Y, Behiels E, Felix J, Elegheert J, Vergauwen B, Devreese B, Savvides SN. The bacterial antitoxin HipB establishes a ternary complex with operator DNA and phosphorylated toxin HipA to regulate bacterial persistence. Nucleic Acids Res. (2014) 42, 10134-10147.