Nieuwe instrumenten voor functionele beeldvorming van de darm organoïden

Over deze onderzoekslijn

Volwassen stamcellen en iPSC-afgeleide darm organoïden bevorderen ons begrip van de ontwikkeling van het darmepitheel, gastheer-microbe-interactie studies en weefsel engineering toepassingen. Recent onderzoek benadrukt het belang van hoge-resolutie en live microscopie methoden, om zo een beter inzicht van organoïden heterogeniteit en metabolisme te verkrijgen. We zijn pioniers op het gebied van organoïden FLIM en O2 PLIM beeldvorming, specifiek hun oxidatieve metabolisme. Momenteel breiden we de beschikbare biosensor toolkit uit voor een verbeterde multifactoriële beoordeling van enkelvoudige en gedifferentieerde cel metabolisme in de organoïden, via niet-invasieve live en multi-parameter FLIM microscopie.

De combinatie van deze benaderingen zal leiden tot een beter inzicht in het weefselgenezingsproces bij patiënten met inflammatoire darmziekten (IBD), betere gastheer- micro-organismen interactie modellen en de rol van voedingsijzer in de intestinale cel homeostase.

Publicaties

  1. Okkelman IA, Neto N, Papkovsky DB, Monaghan MG, Dmitriev RI: A deeper understanding of intestinal organoid metabolism revealed by combining fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM) and extracellular flux analyses. Redox Biology 2020, 30:101420.
  2. Okkelman IA, McGarrigle R, O’Carroll S, Berrio DC, Schenke-Layland K, Hynes J, Dmitriev RI: Extracellular Ca2+-Sensing Fluorescent Protein Biosensor Based on a Collagen-Binding Domain. ACS Applied Bio Materials 2020, 3(8):5310-5321.
  3. Okkelman IA, Foley T, Papkovsky DB, Dmitriev RI: Live cell imaging of mouse intestinal organoids reveals heterogeneity in their oxygenation. Biomaterials 2017, 146:86-96.
  4. O'Donnell N, Okkelman IA, Timashev P, Gromovykh TI, Papkovsky DB, Dmitriev RI: Cellulose-based scaffolds for fluorescence lifetime imaging-assisted tissue engineering. Acta Biomaterialia 2018, 80:85-96.

Vragen?

  • Ruslan Dmitriev, professor/hoofd van de groep

09 332 51 33